Sérülés vagy irritáció - például az orca belső részének véletlen megharapása vagy felsértése, illetve valamilyen irritáló szer, például aszpirin hozzászorítása az ínyhez -hólyagok (vezikulák, bullák), vagy felmart területek kialakulásához vezethetnek a szájban. Ennek felszíne általában hamar felszakad, a hólyag fekéllyé alakul. A jóindulatú fekélyek minden esetben fájdalommal járnak, amíg meg nem gyógyulnak. A szájpadon, illetve a műfogsor záródási vonalának megfelelően kialakuló piros kinövések rosszul illeszkedő protézis következményei.
A száj sérülését néha a nekrotizáló sialometaplasiának nevezett állapot követi. Ilyenkor a sérülés utáni 1-2 napon belül nagy, akár 2-3 cm átmérőjű, tátongó seb alakul ki a szájpadláson. Ijesztő megjelenése ellenére a nekrotizáló sialometaplasia viszonylag fájdalommentes, és kezelés nélkül is elmúlik 2 héten belül. A száj rosszindulatú daganataitól a tünetek alapján, olykor biopsziával (szövetmintavétellel mikroszkópos vizsgálathoz) különíthető el.
Bakteriális fertőzés is vezethet sebek és duzzanat megjelenéséhez a szájban. A fertőzés a szájban egyébként is jelenlevő mikroorganizmusok elszaporodása, vagy egy új mikroorganizmus megjelenésének következménye lehet. A fog és az íny bakteriális fertőzéseinek terjedése gennyel telt tasakot (tályogot) vagy kiterjedt gyulladást eredményezhet. A szuvas alsó fogakból kiinduló a szájfenékre terjedő bakteriális fertőzések néha egy rendkívül súlyos fertőzéshez, a Ludwig-féle anginához vezetnek. A kialakuló duzzanat felfelé nyomhatja a nyelvet, elzárva a légutakat. A fertőzések a felső fogakból átterjedhetnek az agyra.
A szifilisz korai stádiumában a szájban vagy az ajkakon fehér, fájdalmatlan seb
(sánker) kialakulását eredményezheti. 
A seb általában
hetek múlva gyógyul csak meg. Amennyiben a szifiliszt nem kezelték, körülbelül 1-4
hónappal később fehér terület (nyálkahártya folt) jelenik meg a szájban vagy az ajkon. A
sánker és a fehér folt egyaránt erősen fertőző, ezekben a stádiumokban a betegség csók
útján is terjed. A szifilisz késői stádiumában tömött csomó (gumma) jelenhet meg a
nyelven vagy a szájpadon; ebben a stádiumban a betegség már nem fertőző.
A herpesz zoszter, a bárányhimlő és az övsömörnek nevezett, bőrtünetekkel jelentkező fertőző betegségek kialakulásáért felelős kórokozóa herpesz vírus. Ezek a sebek a vírus fellángolásának következményei, ami, a herpesz szimplex vírushoz hasonlóan, sohasem hagyja el a szervezetet. A herpesz zoszter kezelése igen hasonló a súlyos herpesz szimplexéhez, néha azonban a sebek gyógyulása után a száj fájdalma még hosszabb időn keresztül (hetekig, hónapokig) megmarad.
A számos szervet (a szemet, a nemi szerveket, az ízületeket, az ereket, az agyat és az
emésztőrendszert) érintő gyulladásos betegség, a
Behçet-szindróma, visszatérő, fájdalmas sebeket okoz a szájban. A lichen planusz nevű
bőrbetegség szintén jellegzetes szájtünetek kialakulásával járhat együtt, jóllehet ezek
a sebek általában nem annyira kellemetlenek, mint a bőrön jelentkező társaik. Pemfiguszban és bullózus pemfigoidban (mindkettő bőrbetegség)
szintén hólyagok alakulhatnak ki a szájban.
