Mivel az emésztőrendszer jelentős tartalékokkal rendelkezik, az öregedés hatásai viszonylag kicsik a többi szervhez képest. Tagadhatatlan, hogy az öregedés sok emésztési rendellenességben szerepet játszik. Az idős emberekben könnyebben alakul ki divertikulózis és léphet fel emésztési rendellenesség (pl. székrekedés) valamilyen gyógyszer mellékhatásaként.
Nyelőcső:A kor előrehaladtával a nyelőcső-összehúzódások ereje és a felső nyelőcső-záróizom feszülése csökken, de a táplálék mozgását ezek a változások nem befolyásolják. Ennek ellenére sok idős ember hajlamos olyan betegségekre, amelyek befolyásolják a nyelőcső-összehúzódásokat.
Gyomor:Az öregedés során a gyomor-nyálkahártya savval szembeni ellenálló képessége csökken, ezért nőhet a gyomorfekély kialakulásának kockázata, főleg olyan emberekben, akik aszpirint vagy egyéb nem-szteroid gyulladásgátló szert szednek. A kor előrehaladtával a gyomor nem képes annyi élelmet befogadni (a csökkent rugalmasság miatt), a vékonybélbe való ürülése pedig lelassul. Ezek a változások nem okoznak észlelhető tüneteket. Az öregedésnek csekély hatása van a gyomornedvek, például a sav és a pepszin elválasztására, jóllehet a savelválasztást csökkentő állapotok, például az atrófiás gasztritisz, gyakoribbá válnak.
Vékonybél:A vékonybélre az öregedés kevés hatással van, a béltartalom mozgása és a legtöbb tápanyag felszívódása nem sokat változik. A laktáz szintje azonban csökken, ami az idős emberekben a tejtermékekkel szembeni tolerancia csökkenését okozza (tejcukor érzékenység). Egyes baktériumok fokozott elszaporodása (baktérium-túlburjánzás) gyakoribbá válhat, és testsúlycsökkenést okozhat idős korban. A baktériumok túlburjánzása miatt egyes tápanyagok, például a folsav, a vas és a kálcium felszívódása csökkenhet.
Hasnyálmirigy, máj és epehólyag:Az öregedés során a hasnyálmirigy súlya
csökken, a szövet egy részében hegszövet alakul ki (fibrózis). Ezek a változások nem
befolyásolják a hasnyálmirigy nátrium-bikarbonát- és enzim-termelő képességét. A máj és
az epehólyag öregedésével számos anatómiai és mikroszkopikus változás következik be. 
Vastagbél és végbél:A vastagbél nem változik jelentősen az öregedés során. A végbél kicsit megnagyobbodik. A székrekedés gyakoribbá válik. Ennek oka részben a vastagbél-tartalom mozgásának lelassulása, részben a végbél összehúzódásainak csökkenése olyankor, mikor abban széklet található.
